データソース
JpTxGNN は以下のデータソースを統合しています。
日本国内データソース
SSK 薬価基準マスター
| 項目 | 内容 |
|---|---|
| 提供元 | 社会保険診療報酬支払基金 |
| URL | https://www.ssk.or.jp/ |
| データ件数 | 19,317 薬品 |
| 含まれる情報 | 薬価基準コード、販売名、薬価、単位 |
| 更新頻度 | 毎月 |
KEGG DRUG
| 項目 | 内容 |
|---|---|
| 提供元 | 京都大学化学研究所 |
| URL | https://www.kegg.jp/kegg/drug/ |
| データ件数 | 12,639 薬品 |
| 含まれる情報 | 効能・効果、分子式、ATC コード |
| 利用条件 | 学術研究目的 |
PMDA（医薬品医療機器総合機構）
| 項目 | 内容 |
|---|---|
| 提供元 | 独立行政法人 医薬品医療機器総合機構 |
| URL | https://www.pmda.go.jp/ |
| 含まれる情報 | 承認情報、添付文書、安全性情報 |
国際データソース
DrugBank
| 項目 | 内容 |
|---|---|
| 提供元 | DrugBank Online |
| URL | https://go.drugbank.com/ |
| データ件数 | 約 7,958 薬物（TxGNN 収録分） |
| 含まれる情報 | 国際標準識別子、薬理情報、相互作用 |
| 利用条件 | CC BY-NC 4.0（非商用） |
TxGNN 知識グラフ
| 項目 | 内容 |
|---|---|
| 提供元 | Harvard Dataverse |
| URL | https://dataverse.harvard.edu/ |
| ノード数 | 約 129,000 |
| エッジ数 | 約 8,000,000 |
| 含まれる情報 | 薬物-疾病関係、タンパク質相互作用 |
ClinicalTrials.gov
| 項目 | 内容 |
|---|---|
| 提供元 | 米国国立医学図書館 (NLM) |
| URL | https://clinicaltrials.gov/ |
| 含まれる情報 | 臨床試験登録情報 |
PubMed
| 項目 | 内容 |
|---|---|
| 提供元 | 米国国立医学図書館 (NLM) |
| URL | https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/ |
| 含まれる情報 | 医学文献データベース |
日本臨床試験登録
JPRN（Japan Primary Registries Network）
JpTxGNN は以下の日本臨床試験登録機関のデータを参照します：
| 登録機関 | 提供元 | URL |
|---|---|---|
| UMIN-CTR | 大学病院医療情報ネットワーク | https://www.umin.ac.jp/ctr/ |
| JapicCTI | 日本医薬情報センター | https://www.clinicaltrials.jp/ |
| JMACCT | 日本医師会治験促進センター | https://dbcentre3.jmacct.med.or.jp/ |
データ統合フロー
SSK マスター ──────┐
├──→ 統合データ ──→ DrugBank マッピング
KEGG DRUG ─────────┘
↓
TxGNN 予測
↓
リポジショニング候補
データ品質指標
| 指標 | 値 | 目標 |
|---|---|---|
| SSK 薬品数 | 19,317 | - |
| KEGG マッチング率 | 40.8% | >30% |
| DrugBank マッピング率 | 22.5% | >20% |
| 疾病マッピング率 | 66.6% | >50% |
ライセンスと利用条件
- SSK データ: 公開情報
- KEGG データ: 学術研究目的での利用
- DrugBank: CC BY-NC 4.0（非商用利用）
- TxGNN: 研究目的での利用
免責事項
本システムで使用するデータは、各提供元の利用規約に従って使用しています。 データの正確性については各提供元の情報を参照してください。