JpTxGNN について

開発者について

本プラットフォームは 藥提醒科技有限公司（yao.care、法人登記番号 83620786、 12F, No. 220, Sec. 2, Taiwan Blvd., West Dist., Taichung City, Taiwan）が開発・運営しています。

JpTxGNN は、同社の「TxGNN ドラッグリポジショニング」製品ラインの日本サイトです。 同一のシステムは 30 の国と地域に展開されており、それぞれ {CC}TxGNN （JpTxGNN、UsTxGNN、DETxGNN など）と命名され、{cc}txgnn.yao.care で公開されています。 製品概要： https://www.yao.care/medical/txgnn/

TxGNN モデルそのものは Harvard Medical School の Zitnik Lab によって開発され、 Nature Medicine に発表されました。本プラットフォームは、そのモデルの上に 藥提醒科技有限公司 が構築した 本番システムであり、各国の医薬品承認データの統合、知識グラフと深層学習による二重予測、 PubMed / ClinicalTrials によるエビデンス評価、SMART on FHIR による 電子カルテ連携をカバーしています。

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背景

医薬品リポジショニング（ドラッグリポジショニング）は、既存の承認医薬品に新たな適応症を見出す手法です。新薬開発に比べて開発期間とコストを大幅に削減できる可能性があります。

技術スタック

TxGNN 知識グラフ

TxGNN (Therapeutic Knowledge Graph Neural Network) は、医薬品と疾病の関係を予測するための知識グラフベースの機械学習モデルです。

• ノード数: 約129,000
• エッジ数: 約8,000,000
• 関係タイプ: indication, contraindication, off-label use など

データソース

ソース	説明
SSK 医薬品マスター	薬価基準コード、薬価、単位情報
KEGG DRUG	効能・効果、分子式、ATC コード
DrugBank	国際標準医薬品識別子
TxGNN	薬物-疾病関係の知識グラフ

アーキテクチャ

┌─────────────────────────────────────────────────────────┐
│                    JpTxGNN Pipeline                      │
├─────────────────────────────────────────────────────────┤
│  ┌──────────┐   ┌──────────┐   ┌──────────┐            │
│  │   SSK    │ + │   KEGG   │ → │  Merged  │            │
│  │  Data    │   │   Data   │   │   Data   │            │
│  └──────────┘   └──────────┘   └──────────┘            │
│                       ↓                                 │
│  ┌──────────────────────────────────────────┐          │
│  │           DrugBank Mapping               │          │
│  │    (Japanese → International ID)         │          │
│  └──────────────────────────────────────────┘          │
│                       ↓                                 │
│  ┌──────────────────────────────────────────┐          │
│  │           Disease Mapping                │          │
│  │    (Japanese → English Ontology)         │          │
│  └──────────────────────────────────────────┘          │
│                       ↓                                 │
│  ┌──────────────────────────────────────────┐          │
│  │         TxGNN KG Prediction              │          │
│  │    (Find new drug-disease relations)     │          │
│  └──────────────────────────────────────────┘          │
│                       ↓                                 │
│  ┌──────────────────────────────────────────┐          │
│  │          FHIR R4 Resources               │          │
│  │    (MedicationKnowledge, etc.)           │          │
│  └──────────────────────────────────────────┘          │
└─────────────────────────────────────────────────────────┘

品質指標

指標	値	目標
SSK 医薬品数	19,317	-
KEGG マッチング率	40.8%	>30%
DrugBank マッピング率	22.5%	>20%
疾病辞書エントリ	200+	>150

免責事項

本プロジェクトの結果は研究参考のみを目的としており、医療アドバイスを構成するものではありません。

• 予測結果は臨床検証を経ていません
• 医療判断には使用しないでください
• 専門家の助言を必ず求めてください

ライセンス

研究目的のみ使用可能。