JpTxGNN 使用ガイド

はじめに

JpTxGNN は、日本の承認医薬品に対する新規適応症を予測する研究ツールです。 このガイドでは、システムの基本的な使い方を説明します。

基本的な使い方

1. 薬物検索

医薬品検索ページ で薬物名を入力して検索できます。

  • 日本語名: 例)ファモチジン、アスピリン
  • 英語名: 例)Famotidine、Aspirin

2. 予測結果の見方

各薬物ページには以下の情報が表示されます:

項目 説明
DrugBank ID 国際標準識別子(クリックで DrugBank へ)
エビデンスレベル 予測の信頼度(L5 = 計算予測のみ)
承認適応症 KEGG から取得した日本での承認適応症
予測適応症 TxGNN が予測した新規適応症候補

3. エビデンスレベルの理解

レベル 説明 推奨アクション
L1 承認済み -
L2 臨床試験あり 文献確認
L3 症例報告あり 詳細調査
L4 前臨床データ 基礎研究参照
L5 計算予測のみ 仮説として検討

重要: 本システムの予測はすべて L5 です。

高度な使い方

FHIR API

プログラムからデータにアクセスする場合は FHIR API を使用できます。

# 薬物情報の取得
curl https://jptxgnn.yao.care/fhir/MedicationKnowledge/famotidine.json

# 全データの取得
curl https://jptxgnn.yao.care/fhir/Bundle/all-predictions.json

データダウンロード

CSV/JSON 形式のデータは ダウンロードページ から取得できます。

よくある質問

Q: 予測結果はどの程度信頼できますか?

A: 本システムの予測はすべて計算に基づいており、臨床検証されていません。 研究の出発点として使用し、必ず追加の検証を行ってください。

Q: データはどのくらいの頻度で更新されますか?

A: 基礎データ(TxGNN 知識グラフ)は年に数回更新されます。 日本の薬価基準データは毎月更新されます。

Q: 商用利用は可能ですか?

A: 本システムは研究目的のみでの利用を想定しています。 商用利用については個別にお問い合わせください。

Q: 予測に含まれない薬物があるのはなぜですか?

A: 以下の理由で一部の薬物が予測対象外となる場合があります:

  • DrugBank にマッピングできない
  • TxGNN 知識グラフに含まれていない
  • 成分名の翻訳が不完全

注意事項

医療判断への使用禁止

本システムの予測結果を医療判断に使用しないでください。 すべての予測は研究参考のみを目的としています。

引用について

研究で本システムを使用する場合は、適切に引用してください:

JpTxGNN - 日本医薬品リポジショニング予測システム
https://jptxgnn.yao.care/

サポート

  • バグ報告: GitHub Issues
  • お問い合わせ: プロジェクト概要ページを参照

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