JpTxGNN について
背景
医薬品リポジショニング（ドラッグリポジショニング）は、既存の承認医薬品に新たな適応症を見出す手法です。新薬開発に比べて開発期間とコストを大幅に削減できる可能性があります。
技術スタック
TxGNN 知識グラフ
TxGNN (Therapeutic Knowledge Graph Neural Network) は、医薬品と疾病の関係を予測するための知識グラフベースの機械学習モデルです。
- ノード数: 約129,000
- エッジ数: 約8,000,000
- 関係タイプ: indication, contraindication, off-label use など
データソース
| ソース | 説明 |
|---|---|
| SSK 医薬品マスター | 薬価基準コード、薬価、単位情報 |
| KEGG DRUG | 効能・効果、分子式、ATC コード |
| DrugBank | 国際標準医薬品識別子 |
| TxGNN | 薬物-疾病関係の知識グラフ |
アーキテクチャ
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│ JpTxGNN Pipeline │
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│ ┌──────────┐ ┌──────────┐ ┌──────────┐ │
│ │ SSK │ + │ KEGG │ → │ Merged │ │
│ │ Data │ │ Data │ │ Data │ │
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│ ↓ │
│ ┌──────────────────────────────────────────┐ │
│ │ DrugBank Mapping │ │
│ │ (Japanese → International ID) │ │
│ └──────────────────────────────────────────┘ │
│ ↓ │
│ ┌──────────────────────────────────────────┐ │
│ │ Disease Mapping │ │
│ │ (Japanese → English Ontology) │ │
│ └──────────────────────────────────────────┘ │
│ ↓ │
│ ┌──────────────────────────────────────────┐ │
│ │ TxGNN KG Prediction │ │
│ │ (Find new drug-disease relations) │ │
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│ ↓ │
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│ │ FHIR R4 Resources │ │
│ │ (MedicationKnowledge, etc.) │ │
│ └──────────────────────────────────────────┘ │
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品質指標
| 指標 | 値 | 目標 |
|---|---|---|
| SSK 医薬品数 | 19,317 | - |
| KEGG マッチング率 | 40.8% | >30% |
| DrugBank マッピング率 | 22.5% | >20% |
| 疾病辞書エントリ | 200+ | >150 |
免責事項
本プロジェクトの結果は研究参考のみを目的としており、医療アドバイスを構成するものではありません。
- 予測結果は臨床検証を経ていません
- 医療判断には使用しないでください
- 専門家の助言を必ず求めてください
ライセンス
研究目的のみ使用可能。